No es aconsejable dar medicamentos a los humanos, pero si no, la leche materna servirá. Los síntomas de la mayoría de las gastroenteritis en los perros incluyen la disminución del estado mental, la disminución del apetito o incluso la eliminación, los vómitos y la diarrea, y dependiendo de la causa, se suelen administrar diferentes medicamentos al perro. La mayoría de las gastroenteritis requieren medicamentos antiinflamatorios, como la penicilina o las cefalosporinas. La reparación de la mucosa gastrointestinal y la inhibición de la acidez pueden tratarse con inhibidores de la bomba o bloqueadores de los receptores H2. En los casos de disminución de la motilidad gastrointestinal o de obstrucción intestinal, también suelen ser necesarios fármacos que favorezcan la motilidad gastrointestinal. En el caso de la diarrea, suelen ser necesarios medicamentos antidiarreicos. Si la diarrea está causada por un virus, también se requiere medicación antiviral adicional. La gastroenteritis parasitaria suele requerir desparasitación, y la gastroenteritis por cuerpos extraños suele requerir cirugía.
