En primer lugar, la diarrea infecciosa causada por microorganismos como virus y bacterias, o parásitos, se denomina colectivamente diarrea infecciosa. Entre las diarreas infecciosas más comunes desde el punto de vista clínico se encuentran la infección por microvirus, la infección por coronavirus, la infección por Escherichia coli, la infección por Salmonella, así como la infección por Giardia lamblia y la infección por Trichomonas fetus. En segundo lugar, la diarrea endógena, hay una serie de enfermedades internas que causan diarrea, conocidas colectivamente como diarrea endógena. Entre las enfermedades más comunes se encuentran la pancreatitis, las alergias digestivas, la intolerancia alimentaria digestiva, el retraso del extremo posterior del intestino y la diarrea causada por la alteración de la reabsorción de agua en el colon. En tercer lugar, los trastornos, como la inactivación de los probióticos intestinales, las alteraciones de la flora intestinal, el uso inadecuado de antibióticos y los trastornos hormonales, pueden provocar una diarrea desordenada.
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