Cuando un perro tiene duodenitis, los principales signos clínicos son mal humor, pérdida de apetito y vómitos. El vómito es de moco blanco o amarillo, y en los casos graves el perro puede tener un poco de sangre en el vómito y heces negras. Sin embargo, estos signos clínicos por sí solos no son suficientes para administrar la medicación, ya que hay que determinar la gravedad de la inflamación. Se necesitan más pruebas para determinar la localización de la inflamación. En las primeras fases de la enfermedad, el intestino es hiperactivo, con diversos grados de dolor abdominal, heces acuosas mezcladas con moco y pus, y un fuerte olor en las heces. En las últimas fases, el ano está flácido, los intestinos son incontinentes y deprimidos, y pronto se produce un estado de deshidratación. Cuando la enfermedad se deteriora más, las extremidades se enfrían y la muerte por insuficiencia cardíaca puede producirse rápidamente si no se trata.
