Entre las desventajas del Border Collie se encuentra el hecho de ser excesivamente inteligente, por lo que a veces el Border Collie jugará bromas a su dueño y le hará sentirse muy enérgico cuando esté con ellos todos los días, aunque muchos dueños siguen teniendo la sensación de que «las personas son peores que los perros». Las desventajas del Border Collie incluyen su alto nivel de energía. El Border Collie es, después de todo, un perro pastor, por lo que es muy enérgico y tiene una alta necesidad de ejercicio. Por eso, cada vez que el dueño lo saca a hacer ejercicio, puede estar cansado y ni siquiera se siente cansado. Así que lo mejor es llevar al Border Collie a correr una hora para quemar su energía. Las desventajas del Border Collie incluyen la muda severa El Border Collie muda tanto como el Golden, ambos mudan mucho, así que los dueños del Border Collie deben estar preparados. Sin embargo, la muda puede mejorarse peinando su pelo todos los días y eligiendo un alimento para perros bajo en sal para reducir la muda. Las desventajas del Border Collie incluyen el hecho de que los huskies son muy buenos para romper hogares, pero el Border Collie no es menos bueno para romper hogares. La razón es que no puede sacar su energía, así que no se sorprenda si llega a casa un día y encuentra la casa desordenada, en realidad es una sorpresa del Border Collie. Los puntos débiles del Border Collie incluyen ser tímido y temeroso El Border Collie no es pequeño, pero es inesperadamente tímido y temeroso. Aunque parezca que son una gran cosa en su propio terreno, casi la mitad de ellos han experimentado incontinencia tras ser asustados. Y a veces incluso tienen miedo de los perros más pequeños que ellos.
